Paus Alexander versterkt zijn macht en invloed met de hulp van twee loyale bondgenoten: Cesare stelt het familiefortuin veilig en verdedigt het pausdom en Rome zelf tegen zijn vijanden. Giulia Farnese helpt Alexander goede werken te verwezenlijken, die zijn nalatenschap veilig moeten stellen. Lucrezia streeft om controle te krijgen over haar eigen lot. Juan drijft een wig tussen de Borgia-broers en zussen, waardoor Cesare de ultieme misdaad begaat. Della Rovere beraamt plannen om de paus met alle mogelijke middelen ten val te brengen.